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基因多态性与河南汉族人群非小细胞肺癌的关系
作者:网站采编关键词:
摘要:葡萄糖转运蛋白1(glucose transporter 1, GLUT1)是人类最早发现的GLUT,广泛存在于人体的各种细胞的表面,是葡萄糖转运进入细胞进行能量代谢的主要转运体。肿瘤细胞能量代谢活跃,细胞
葡萄糖转运蛋白1(glucose transporter 1, GLUT1)是人类最早发现的GLUT,广泛存在于人体的各种细胞的表面,是葡萄糖转运进入细胞进行能量代谢的主要转运体。肿瘤细胞能量代谢活跃,细胞表面GLUT1存在异常高表达现象[1-3]。JIANG 等[4]研究证实非小细胞肺癌患者GLUT1 蛋白表达异常升高,并且DO 等[5]研究提示GLUT1SLC2A1基因多态性与肺癌患者预后相关,表明SLC2A1基因多态性可能与非小细胞肺癌存在一定相关性。XbaI G>T(rs)和-2841 A>T(rs)位点在亚洲人群中存在较高的突变频率。因此,本研究考察XbaI G>T 和-2841 A>T 基因多态性与河南汉族人群非小细胞肺癌的关系。
1 资料与方法
1.1 一般资料
选取2018年10月—2019年3月郑州大学第一附属医院河南汉族人群非小细胞肺癌患者112 例。其中,男性67 例,年龄43 ~84 岁,平均(61.)岁;女性45 例,年龄41 ~79 岁,平均(64.)岁。
采用世界卫生组织肺癌组织类型划分标准进行病理分型(病理类型划分为鳞癌、腺癌、鳞腺癌),采用国际肺癌临床分期系统进行临床分期(临床分期为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ期)。
1.2 试剂与方法
1.2.1 DNA 提取抽取受试者周围静脉血2 ml,2%乙二胺四乙酸(EDTA)抗凝,严格参照试剂盒说明书提取基因组DNA。试剂盒购自北京康为世纪生物科技有限公司。
1.2.2 PCR引物由郑州博兴生物科技有限公司提供。GLUT1 XbaI G>T 基因片段扩增:正向引物为5'-GTGCAACCCATGAGCTAACAA-3',反向引物为5'-AACCCAGCACTCTGTAGCC-3';-2841 A>T 基因片段扩增:正向引物为 5'-TGAGAATGGCCTTCCCTCAAT-3',反向引物为5'-TCTGCCTTACTCAGCCCATG-3'。PCR 反应体系总体积50 μl:2×Es Taq Master Mix(Dye)25 μl,Template DNA <0.5 μg(<0.5 μg/50 μl),Forward Primer 0.4 μmol/L,Reverse Primer 0.4 μmol/L,ddH2O 加 至50 μl。PCR反应条件:94 ℃预变性2 min,94℃变性30 s,60℃退火30 s,72℃延伸30 s,共31 个循环,72℃再延伸2 %~2.0%琼脂糖凝胶电泳法检测扩增结果。由北京三博远志生物技术有限公司进行最终测序工作。
1.3 统计学方法
数据分析采用SPSS 21.0 统计软件。拟合优度、基因型构成比及等位基因频率的比较采用χ2检验,P<0.05 为差异有统计学意义。
2 结果
2.1 非小细胞肺癌患者SLC2A1基因多态性分布
SLC2A1基因多态性位点XbaI G>T 和-2841 A>T的基因频率均符合Hardy-Weinberg 平衡法则(P>0.05),说明群体基因遗传平衡,样本抽样无明显偏差(见表1)。XbaI G>T 多态性位点GG、GT、AA 基因型频率分别为53.6%、43.8%和2.6%,G、T 等位基因频率分别为75.4%和24.6%。这与千人基因组计划[6]在亚洲人群(样本量1008 例)中G、T 等位基因的频率(G=78.1%,T=21.9%)比较,差异无统计学意义(χ2=0.807,P=0.397)。-2841 A>T 多态性位点AA、AT、TT 基因型频率分别为50.0%、41.0%和9.0%,A、T 等位基因频率分别为71.0%和29.0%,与千人基因组计划在亚洲人群中A、T 等位基因的频率(G=63.8%,T=36.2%)比较,差异无统计学意义(χ2=4.000,P=0.05)。
基因多态性与非小细胞肺癌病理类型的关系
112 例非小细胞肺癌患者中腺癌86 例,鳞癌24例,鳞腺癌2 例。腺癌XbaI G>T 位点GG、GT、TT基因型频率分别为52.3%、44.2%和3.5%;鳞癌XbaI G>T 位点GG、GT、TT 基因型频率分别为58.3%、41.7%和0.0%,两组构成比比较,差异无统计学意义(χ2=0.991,P=0.609);腺癌G、T 等位基因频率分别为74.4%和25.6%;鳞癌G、T 等位基因频率分别为79.2%和20.8%,两组构成比比较,差异无统计学意义(χ2=0.457,P=0.499)。见表2。
表1 两组XbaI G>T 和-2841 A>T 基因型分布比较XbaI G>T 基因型 -2841 A>T 基因型GG GT TT AA AT TT观察组 60 49 3 56 46 10理论组 64 41 7 55 47 10 χ2 值 3.660 0.020 P 值 0.056 0.900组别
腺癌-2841 A>T 位点AA、AT、TT 基因型频率分别为48.8%、40.7%和10.5%;鳞癌-2841 A>T 位点AA、AT、TT 基因型频率分别为50.0%、45.8%和4.2%,两组构成比比较,差异无统计学意义(χ2=1.885,P=0.390);腺癌A、T 等位基因频率分别为69.2%和30.8%;鳞癌A、T 等位基因频率分别为72.9%和27.1%,两组构成比比较,差异无统计学意义(χ2=0.249,P=0.681)。见表3。
基因多态性与非小细胞肺癌分期的关系
Ⅰ~Ⅳ期非小细胞肺癌的XbaI G>T 位点GG 基因型频率分别为58.1%、27.3%、48.0%和60.6%;GT 基因型频率分别为41.9%、63.6%、44.0%和39.4%;TT基因型频率分别为0.0%、9.1%、8.0%和0.0%,不同分期构成比比较,差异无统计学意义(χ2=5.494,P=0.139);G 等位基因频率分别为91.1%、59.1%、70.0%和80.3%,T 等位基因频率分别为8.9%、40.9%、30.0%和19.7%,不同分期构成比比较,差异无统计学意义(χ2=5.403,P=0.145)。见表4。
文章来源:《河南图书馆学刊》 网址: http://www.hntsgxk.cn/qikandaodu/2021/0624/1639.html
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